Unit Kesehatan Sekolah (UKS) di MTs Al Ma’had An-Nur berfungsi sebagai pusat pelayanan kesehatan sederhana sekaligus sarana pendidikan kesehatan bagi warga madrasah, ruang UKS dilengkapi dengan tempat tidur, kotak P3K, perlengkapan medis sederhana, serta poster edukasi kesehatan.